Pues super sencillo solo haces click en inicio , luego en ejecutar y allí escribes cmd

Luego te saldrá un cuadro negro , en este cuadro debes escribir la letra que corresponde a tu memoria usb supongamos que es F:

Entonces pondrías---------> F:   y  presionas enter 
Después ---------> Attrib -s -r -h /s /d   y  presionas enter
Nota: debes ponerlo tal cual con espacios 

Así todos los archivos ocultos aparecerán para que después le pases tu antivirirus y quede limpio a mi me funciona a la perfección lo he usado mucho espero te sirva 
hehe espero haberme explicado bien, si no, ahí esta mi mail.

correodepierre@hotmail.com